События игры развиваются после всех основных кампаний, проходивших в Metro Exodus. В центре истории – один из спартанцев, вырвавшихся из оцепленного района и теперь обитающих на Байкале, где они обрели новое убежище. Это бывший американский морпех Сэм, когда-то охранявший московское посольство. Сэм долго не был дома и очень переживает, что не успеет повидаться с престарелым отцом. Поэтому он принимает решение отправиться в нелегкий путь и добраться до Америки. Логичнее всего начать двигать на восток к побережью Тихого океана. Помогите Сэму преодолеть огромное расстояние и справится со всеми невзгодами, ведь территория по которой ему предстоит идти по-прежнему смертельно опасна.